Vamos por partes... personalmente no me queda claro lo que pretendes o quieres hacer.
Lo que entiendo:
Primero: todos los usuarios deben estar/tener como grupo de usuario primario el de Usuarios Registrados y a partir de ahí como secundarios el resto de grupos, esto es la forma correcta de que trabajen los grupos y permisos en XenForo ya que son los permisos son acumulativos.
Segundo: seguramente, según lo que yo entiendo, lo que pides puedase hacer con los banners de los grupos de usuarios, dentro de las opciones de cada grupo de usuarios la segunda opción que tienes es "Prioridad estética de visualización" con la cual se puede controlar que el banner se muestre al principio, en medio, al final o en el más allá. Para que se muestren todos los banners es necesario activar/seleccionar la casilla "Permitir apilamiento de banners" en Panel de administración --> Opciones --> Opciones de usuario --> Baners de usuario.
Si he acertado hay que enviarme un aplauso...